Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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COL4A6Q14031 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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COL4A6Q14031 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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COL4A6Q14031 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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COL4A6Q14031 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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COL4A6Q14031 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL4A6Q14031 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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