Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD11P31277 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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