Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM2AQ9Y2K7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms