Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC4Q9Y296 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms