Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC6Q9Y210 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms