Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC5Q9UQL6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC5Q9UQL6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms