Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI0

ATAD2B, ATPase family AAA domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2BQ9ULI0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATAD2BQ9ULI0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
ATAD2BQ9ULI0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ATAD2BQ9ULI0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATAD2BQ9ULI0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATAD2BQ9ULI0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATAD2BQ9ULI0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATAD2BQ9ULI0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATAD2BQ9ULI0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms