Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PARP4Q9UKK3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms