Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms