Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms