Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPC1L1Q9UHC9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPC1L1Q9UHC9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms