Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CFDP1Q9UEE9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms