Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
REREQ9P2R6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
REREQ9P2R6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms