Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PHRF1Q9P1Y6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHRF1Q9P1Y6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms