Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMG20BQ9P0W2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms