Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms