Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELL3Q9HB65 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms