Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKRIP1Q9H875 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms