Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1DQ9H5J8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1DQ9H5J8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms