Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDEM3Q9BZQ6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms