Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GSDMCQ9BYG8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms