Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPIN3Q9BQK8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms