Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CITED1Q99966 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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