Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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