Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms