Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00526Q96FQ7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00526Q96FQ7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms