Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-CQ95604 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms