Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PRG4Q92954 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRG4Q92954 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms