Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FNDC9Q8TBE3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms