Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC4Q8TBB5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms