Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTC29Q8NA56 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms