Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms