Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms