Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms