Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4L9Q6RFH8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms