Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF3Q5VWG9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF3Q5VWG9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms