Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms