Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIF1Q5UIP0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms