Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC93Q567U6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms