Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEP55Q53EZ4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms