Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms