Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDRF1Q3B7T1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDRF1Q3B7T1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms