Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPHKAPQ2M3C7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
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