Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLPPQ16740 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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