Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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FOXD1Q16676 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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FOXD1Q16676 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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FOXD1Q16676 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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FOXD1Q16676 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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FOXD1Q16676 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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FOXD1Q16676 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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FOXD1Q16676 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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FOXD1Q16676 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
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