Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKN3Q16667 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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