Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms