Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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