Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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