Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PUM3Q15397 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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